PlasmidLab / 무료 도구 / 제한효소 자리
DNA 서열에서 제한효소 자리 찾기
DNA를 붙여 넣으면 제한효소 162종 가운데 어떤 것이 몇 번, 어디를 자르는지 보여줍니다. 플라스미드라면 원형을 고르십시오. 원점을 걸치고 있는 제한효소 사이트까지 찾습니다.
서열
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결과 읽는 방법
위치는 효소가 위쪽 가닥을 자르는 자리입니다. 396이면 396번과 397번 염기 사이를 자릅니다. 효소 옆의 막대는 서열 전체에서 절단 자리가 어디에 있는지 보여줍니다. AccI의 GTMKAC처럼 IUPAC 코드가 든 인식 부위는 양쪽 가닥에서 찾고 BsaI GGTCTC(1/5)처럼 인식 부위 밖을 자르는 효소는 실제로 자르는 위치에 표시합니다. 선형 서열에서 절단 자리가 양쪽 끝에 걸리거나 끝을 넘어가면 목록에 넣지 않습니다.
Dam과 Dcm 메틸화는 여기서 고려하지 않습니다. 메틸화가 막는 자리는 PlasmidLab 앱에서 표시할 수 있습니다.
인식 부위와 절단 위치는 제한효소 데이터베이스 REBASE(rebase.neb.com) release 611에서 가져왔습니다. PlasmidLab 앱이 쓰는 것과 같은 효소 목록입니다.