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DNA를 6개 프레임으로 번역하고 ORF 찾기

DNA를 붙여 넣으면 정방향 세 개와 역방향 세 개, 모든 프레임의 단백질을 표준 유전 암호로 보여줍니다. 종결 코돈은 *로 표시합니다. ATG에서 종결 코돈까지의 ORF를 표시하고 가장 긴 것은 위치와 함께 따로 알려줍니다.

MKV… ORF(열린 해독틀)MKV… 가장 긴 ORF* 종결 코돈 · X 모호한 코돈

프레임을 읽는 방식

프레임 +1, +2, +3은 붙여 넣은 서열의 첫 번째, 두 번째, 세 번째 염기에서 시작합니다. 프레임 −1, −2, −3은 역상보 서열에서 같은 일을 하므로 아래쪽 가닥을 5′에서 3′ 방향으로 읽습니다. 위치는 붙여 넣은 서열의 좌표로 표시합니다.

여기서 ORF는 종결 코돈 뒤 또는 프레임이 시작한 뒤 처음 나오는 ATG에서 시작해 다음 종결 코돈까지입니다. 종결 코돈을 만나지 못하고 서열 끝에 닿은 것도 표시하고 종결 코돈이 없다고 따로 적어 둡니다. IUPAC 코드가 든 코돈은 가능한 모든 해독이 같은 아미노산을 줄 때만 번역합니다. GCN은 A입니다. 그렇지 않으면 X로 표시합니다.